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肿瘤微卫星不稳定性检测系统

日期: 2017-06-15
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 微卫星不稳定性及DNA错配修复

微卫星是短串联重复DNA序列,长度1-6个碱基对。这些重复序列广泛存在于基因组中,并且由于其在基因座位点串联重复次数不同,这些重复序列的长度在不同个体中经常有差异。微卫星标志物可以用于检测微卫星不稳定性(基因组不稳定性的一种)。微卫星不稳定(Microsatellite Instability,MSI)是微卫星等位基因长度的改变,这种改变是由于DNA复制过程中重复单元的插入或删除以及DNA错配修复系统纠错失败造成的。

 

DNA错配修复(DNA mismatch repair system,MMR)是一类能识别并修复DNA复制及重组过程中的碱基的错误插入、删除或错配的系统,该修复系统主要包括4个蛋白,MLH、MSH2、MSH6和PMS2。微卫星对MMR易感,MMR系统正常时呈现微卫星稳定(Microsatellite Stable,MSS),缺失某个MMR蛋白功能时导致MMR系统缺陷,致微卫星复制错误累积,呈现微卫星不稳定(MSI)。组织出现MSI也即意味着DNA错配修复系统(MMR)失活。最新的研究表明:伴随着MMR失活的MSI表型是临床上的一项重要的肿瘤标志物。

 

MSI检测用于筛查林奇综合症

结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)发生的遗传因素包括染色体不稳定性(Chromosome Instability,CIN)和微卫星不稳定性(Microsatellite Instability,MSI)。约80%-85%的结直肠癌由CIN引起,另外15%-20%由MSI引起的,包括遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)和散发性MSI结直肠癌。

遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC),又称为林奇综合症(LS),是一种常染色体显性遗传病,由于DNA错配修复(MMR)基因发生胚系突变所致,约占所有结直肠癌的3-5%。

 

林奇综合症筛查方案

MSI检测特点:

推荐,有更好地灵敏度

标准化的检测流程,诊断结果客观、易判读

基本不受样本质量、实验操作影响,可重复性好

功能性检测,不能确定突变基因

免疫组化(IHC)分析特点:

经典方法学,灵敏度稍低

受样本质量、抗体来源影响大,诊断结果可重复性差

非标准化检测流程,对实验操作有较高要求

可确认突变基因

DNA测序特点:

MMR基因无热点突变,导致数据分析困难

基因突变/表型缺乏相关性

遗漏大片段的基因缺失

在缺MSI或IHC信息的情况下,测序结果不可靠

适用于最终确诊,而非筛查

 

肿瘤微卫星不稳定性检测系统

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